Queullín se encuentra al sureste de Isla Puluqui con la cual forma el paso Perhue (o Queullín), la principal conexión entre el seno de Reloncaví y el golfo de Ancud. Tiene a corta distancia, hacia el sureste, a isla Nao y punta Tentelhué, pertenecientes a la comuna de Hualaihué con las cuales separa al seno de Reloncaví del golfo de Ancud. Es la isla más alejada del archipiélago —y la más próxima al litoral de la provincia de Palena — situándose aproximadamente a 20 km al sureste de la ciudad de Calbuco.

A diferencia de otras islas del archipiélago, Queullín recién comenzó a poblarse permanentemente a contar de las primeras décadas del siglo xix.